Esta questão é das que suscita discussões mais acesas, e parece demorar a passar. Dois links interessantes:

Objects and Databases: State of the Union 2006
http://www.ddj.com/dept/database/194400088?cid=RSSfeed_DDJ_DataBase

e este é para o db4o, uma bd object oriented para .net e java que anuncia desempenho bom (superior ao hibernate, pelo menos), e que teve agora uma nova versão:
http://www.db4o.com/community/

O tema também já foi discutido aqui em parte:
http://www.arquitecturadesoftware.org/forums/thread/21.aspx

(eu continuo convertido ao CodeSmith com templates NetTiers. :-))